Penerimaan Mahasiswa (Pena Mas) merupakan seleksi penerimaan mahasiswa baru di Universitas Islam Sultan Agung, terdiri dari penerimaan mahasiswa untuk jenjang DIII, S1, S2 dan Profesi.

Untuk jenjang S1 terdapat dua jalur penerimaan, yaitu PSB (Penelusuran Siswa Berprestasi) dan PMB (Penerimaan Mahasiswa Baru). Untuk PMB calon mahasiswa dapat melakukan pendaftaran secara langsung datang ke kampus atau melalui online. Untuk jenjang DIII dan S1 jalur penerimaan yang dipergunakan adalah PMB. Kemudian untuk jenjang S2 dan Profesi, seleksi dilaksanakan pada fakultas masing-masing. Sedangakan untuk mahasiswa transfer dari DIII ke S1 dapat menghubungi fakultas yang bersangkutan.

Sistem Pendaftaran di Unissula adalah One Day Service, mahasiswa datang langsung ke kampus Unissula setelah itu melakukan pendaftaran kepada panitia, megisi dengan lengkap lembar formulir pendaftaran beserta melengkapi persyaratan-persyaratan yang sudah ditentukan oleh panitia. Setelah proses tersebut selesai dilakukan para calon mahasiswa baru selanjutnya mengikuti Ujian dengan menggunakan komputer, hasil ujian lulus dan tidak lulus dapat di tunggu hari itu juga berlaku untuk semua fakultas keculai kedokteran umum, farmasi dan kedokteran gigi.

Khusus untuk fakultas kedokteran umum, farmasi dan kedokteran gigi pengumumam lulus dan tidak lulus dapat diketahui setelah dua minggu tepatnya hari jum’at, yang akan diumumkan melalui website unissula www.unissula.ac.i atau www.pmb.unissula.ac.id