Direktorat Pemakmuran Masjid (DPkM) dipimpin oleh seorang Kepala yang dikoordinir oleh Wakil Rektor III dan berada di bawah dan bertanggung jawab kepada Rektor. DPkM  terdiri  atas  Sub Direktorat  Peribadatan  &  Kaderisasi,  dan  Sub Direktorat Pusat Studi AI-Qur’an (Qur’an Learning Center).

Direktorat Pemakmuran Masjid (DPkM) memiliki tugas :

1. Menyediakan pelayanan Sistem lnformasi Pemakmuran Masjid (51-PM) online & realtime guna kelancaran pelaksanaan peribadatan, kaderisasi dan pembelajaran ai-Qur’an.
2. Merancang, memfasilitasi  dan  mengkoordinir  berbagai  macam  peribadatan  dosen,  karyawan  dan mahasiswa UNISSULA serta masyarakat yang membutuhkan, dalam rangka:
   • Kaderisasi kepemimpinan guna melahirkan para pemimpin organisasi dan
   • Pemantapan dan peningkatan kualitas Budaya Akademik lslami (BudAI) terus
3. Merancang,  memfasilitasi  dan  mengkoordinir   berbagai   macam   pembelajaran  AI-Qur’an   bagi  dosen, karyawan & mahasiswa UNISSULA serta
4. Merencanakan dan mengkoordinir peningkatan peran a lim ulama guna pengembangan
5. Merencanakan dan mengkoordinir peningkatan peran DPkM bagi kepentingan
6. Mengendalikan dan mengawasi  pelaksanaan  peribadatan,  kaderisasi dan  pembelajaran  ai-Qur’an di seluruh unsur organisasi
7. Menyusun pelaporan yang akurat, akuntable, dan realtime serta menggunakan program Sistem lnformasi yang disiapkan DSI